Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms