Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
POLR2KP53803 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms