Protein–RNA interactions for Protein: P49459

UBE2A, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 A, humanhuman

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Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2AP49459 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 HS3ST1-201ENST00000002596 8031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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UBE2AP49459 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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UBE2AP49459 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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UBE2AP49459 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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UBE2AP49459 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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UBE2AP49459 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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UBE2AP49459 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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