Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms