Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms