Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms