Protein–RNA interactions for Protein: H3BU77

CCDC179, Coiled-coil domain-containing protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC179H3BU77 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 ARMCX2-202ENST00000330154 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 PISD-202ENST00000382151 2669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 CLINT1-201ENST00000411809 3440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 KLHL38-201ENST00000325995 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 NFATC4-209ENST00000553879 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 LIMK2-202ENST00000333611 3462 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 ERVK13-1-205ENST00000568395 5578 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 NBN-203ENST00000409330 4523 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 SLCO2B1-204ENST00000454962 3219 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 PRKCQ-203ENST00000539722 3224 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 GRIN2A-206ENST00000562109 4338 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 GPC3-201ENST00000370818 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 CRHR2-201ENST00000341843 3131 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 DERL3-203ENST00000404056 3113 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 VAX1-201ENST00000277905 4494 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 MICAL2-201ENST00000256194 3906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 ASB2-203ENST00000555019 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 ARHGEF4-212ENST00000525839 3828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 SLC6A1-201ENST00000287766 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 TSPAN9-201ENST00000011898 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 TMCC2-208ENST00000545499 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 RNGTT-202ENST00000369485 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 PPP6R2-209ENST00000612753 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 SEC31A-202ENST00000311785 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 BAIAP3-204ENST00000426824 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 REST-208ENST00000619101 7114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 ANAPC7-203ENST00000455511 3045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 ALDH4A1-202ENST00000375341 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 TXLNG-202ENST00000398155 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 ZNF706-209ENST00000520347 3502 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 SLC13A2-201ENST00000314669 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 SEPT10-201ENST00000356688 3091 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 KCNH1-202ENST00000367007 3445 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 SCNN1D-202ENST00000338555 3475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 PAX2-201ENST00000355243 4057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 GMEB2-201ENST00000266068 4559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 DNAJB12-203ENST00000444643 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 NQO2-205ENST00000380455 10084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 PSME3-217ENST00000622892 3183 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 NECTIN2-201ENST00000252483 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 AC137834.1-201ENST00000548184 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CCDC179H3BU77 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms