Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms