Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VAPAQ9P0L0 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAPAQ9P0L0 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAPAQ9P0L0 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAPAQ9P0L0 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
VAPAQ9P0L0 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAPAQ9P0L0 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAPAQ9P0L0 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAPAQ9P0L0 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAPAQ9P0L0 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAPAQ9P0L0 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAPAQ9P0L0 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAPAQ9P0L0 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAPAQ9P0L0 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAPAQ9P0L0 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms