Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms