Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms