Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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