Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTTNQ14247 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTTNQ14247 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTTNQ14247 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTTNQ14247 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTTNQ14247 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTTNQ14247 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTTNQ14247 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTTNQ14247 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTTNQ14247 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTTNQ14247 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTTNQ14247 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTTNQ14247 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTTNQ14247 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTTNQ14247 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTTNQ14247 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTTNQ14247 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTTNQ14247 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CTTNQ14247 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTTNQ14247 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTTNQ14247 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTTNQ14247 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTTNQ14247 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CTTNQ14247 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTTNQ14247 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTTNQ14247 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTTNQ14247 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTTNQ14247 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTTNQ14247 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CTTNQ14247 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTTNQ14247 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTTNQ14247 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTTNQ14247 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTTNQ14247 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTTNQ14247 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTTNQ14247 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CTTNQ14247 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CTTNQ14247 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTTNQ14247 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTTNQ14247 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTTNQ14247 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTTNQ14247 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTTNQ14247 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTTNQ14247 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTTNQ14247 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTTNQ14247 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTTNQ14247 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTTNQ14247 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms