Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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CBX3Q13185 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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CBX3Q13185 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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CBX3Q13185 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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CBX3Q13185 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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CBX3Q13185 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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CBX3Q13185 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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CBX3Q13185 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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CBX3Q13185 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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