Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms