Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMBRP28336 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMBRP28336 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMBRP28336 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMBRP28336 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMBRP28336 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBRP28336 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBRP28336 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBRP28336 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBRP28336 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBRP28336 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBRP28336 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBRP28336 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBRP28336 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBRP28336 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBRP28336 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBRP28336 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBRP28336 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBRP28336 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBRP28336 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBRP28336 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBRP28336 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBRP28336 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBRP28336 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBRP28336 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBRP28336 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBRP28336 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBRP28336 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBRP28336 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBRP28336 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBRP28336 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBRP28336 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBRP28336 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBRP28336 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBRP28336 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBRP28336 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBRP28336 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBRP28336 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBRP28336 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBRP28336 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBRP28336 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBRP28336 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBRP28336 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBRP28336 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBRP28336 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBRP28336 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBRP28336 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBRP28336 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBRP28336 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBRP28336 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBRP28336 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBRP28336 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMBRP28336 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMBRP28336 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMBRP28336 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMBRP28336 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMBRP28336 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMBRP28336 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMBRP28336 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMBRP28336 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMBRP28336 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMBRP28336 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMBRP28336 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMBRP28336 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMBRP28336 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMBRP28336 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMBRP28336 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NMBRP28336 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMBRP28336 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMBRP28336 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMBRP28336 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMBRP28336 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMBRP28336 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMBRP28336 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMBRP28336 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMBRP28336 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMBRP28336 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMBRP28336 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMBRP28336 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMBRP28336 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NMBRP28336 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMBRP28336 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMBRP28336 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMBRP28336 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMBRP28336 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMBRP28336 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NMBRP28336 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMBRP28336 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMBRP28336 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMBRP28336 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMBRP28336 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMBRP28336 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMBRP28336 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMBRP28336 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMBRP28336 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMBRP28336 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMBRP28336 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMBRP28336 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMBRP28336 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMBRP28336 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms