Protein–RNA interactions for Protein: P23942

PRPH2, Peripherin-2, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPH2P23942 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRPH2P23942 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRPH2P23942 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRPH2P23942 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRPH2P23942 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRPH2P23942 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRPH2P23942 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRPH2P23942 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRPH2P23942 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRPH2P23942 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRPH2P23942 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRPH2P23942 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRPH2P23942 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRPH2P23942 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRPH2P23942 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRPH2P23942 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRPH2P23942 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRPH2P23942 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRPH2P23942 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRPH2P23942 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRPH2P23942 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRPH2P23942 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRPH2P23942 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRPH2P23942 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRPH2P23942 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRPH2P23942 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRPH2P23942 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRPH2P23942 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRPH2P23942 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRPH2P23942 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRPH2P23942 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRPH2P23942 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRPH2P23942 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRPH2P23942 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRPH2P23942 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRPH2P23942 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRPH2P23942 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRPH2P23942 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRPH2P23942 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRPH2P23942 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRPH2P23942 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRPH2P23942 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRPH2P23942 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRPH2P23942 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRPH2P23942 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRPH2P23942 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRPH2P23942 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRPH2P23942 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRPH2P23942 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRPH2P23942 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRPH2P23942 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRPH2P23942 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRPH2P23942 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRPH2P23942 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRPH2P23942 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRPH2P23942 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRPH2P23942 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRPH2P23942 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRPH2P23942 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRPH2P23942 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PRPH2P23942 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRPH2P23942 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRPH2P23942 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRPH2P23942 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRPH2P23942 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRPH2P23942 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRPH2P23942 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRPH2P23942 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRPH2P23942 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRPH2P23942 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRPH2P23942 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRPH2P23942 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRPH2P23942 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRPH2P23942 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRPH2P23942 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRPH2P23942 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRPH2P23942 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRPH2P23942 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRPH2P23942 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRPH2P23942 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRPH2P23942 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRPH2P23942 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRPH2P23942 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRPH2P23942 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRPH2P23942 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRPH2P23942 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRPH2P23942 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRPH2P23942 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRPH2P23942 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRPH2P23942 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRPH2P23942 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRPH2P23942 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRPH2P23942 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PRPH2P23942 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRPH2P23942 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRPH2P23942 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRPH2P23942 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRPH2P23942 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PRPH2P23942 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PRPH2P23942 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms