Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTMAP06454 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTMAP06454 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTMAP06454 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTMAP06454 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTMAP06454 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTMAP06454 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTMAP06454 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTMAP06454 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTMAP06454 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTMAP06454 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTMAP06454 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTMAP06454 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTMAP06454 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTMAP06454 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTMAP06454 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTMAP06454 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTMAP06454 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTMAP06454 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTMAP06454 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTMAP06454 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTMAP06454 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTMAP06454 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTMAP06454 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTMAP06454 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTMAP06454 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTMAP06454 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTMAP06454 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTMAP06454 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTMAP06454 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTMAP06454 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTMAP06454 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTMAP06454 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTMAP06454 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTMAP06454 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTMAP06454 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTMAP06454 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTMAP06454 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTMAP06454 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTMAP06454 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTMAP06454 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTMAP06454 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTMAP06454 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTMAP06454 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTMAP06454 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTMAP06454 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTMAP06454 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTMAP06454 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTMAP06454 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTMAP06454 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTMAP06454 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTMAP06454 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTMAP06454 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTMAP06454 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTMAP06454 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTMAP06454 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTMAP06454 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTMAP06454 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTMAP06454 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTMAP06454 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTMAP06454 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTMAP06454 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTMAP06454 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTMAP06454 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTMAP06454 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTMAP06454 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTMAP06454 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTMAP06454 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTMAP06454 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTMAP06454 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTMAP06454 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTMAP06454 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTMAP06454 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTMAP06454 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTMAP06454 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTMAP06454 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTMAP06454 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTMAP06454 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTMAP06454 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTMAP06454 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTMAP06454 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTMAP06454 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTMAP06454 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTMAP06454 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTMAP06454 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTMAP06454 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTMAP06454 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTMAP06454 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTMAP06454 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTMAP06454 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTMAP06454 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTMAP06454 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTMAP06454 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTMAP06454 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTMAP06454 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTMAP06454 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTMAP06454 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTMAP06454 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTMAP06454 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTMAP06454 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms