Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms