Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms