Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APEX2Q9UBZ4 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APEX2Q9UBZ4 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APEX2Q9UBZ4 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APEX2Q9UBZ4 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APEX2Q9UBZ4 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APEX2Q9UBZ4 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APEX2Q9UBZ4 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APEX2Q9UBZ4 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APEX2Q9UBZ4 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APEX2Q9UBZ4 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APEX2Q9UBZ4 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APEX2Q9UBZ4 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APEX2Q9UBZ4 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APEX2Q9UBZ4 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APEX2Q9UBZ4 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APEX2Q9UBZ4 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
APEX2Q9UBZ4 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
APEX2Q9UBZ4 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
APEX2Q9UBZ4 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
APEX2Q9UBZ4 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APEX2Q9UBZ4 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
APEX2Q9UBZ4 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APEX2Q9UBZ4 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APEX2Q9UBZ4 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms