Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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