Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms