Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 PITPNM3-202ENST00000421306 6945 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 TNRC6C-211ENST00000636222 7093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 DPYSL5-207ENST00000614712 5128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 PASK-203ENST00000403638 5161 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 MTHFR-205ENST00000376592 8378 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 KCNA1-201ENST00000382545 7997 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 ERBB2-202ENST00000406381 4564 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 SETD4-207ENST00000399215 4272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 OR4K13-203ENST00000641904 5684 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 FANCA-202ENST00000389301 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 C15orf40-201ENST00000304177 11244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 HSPA12A-201ENST00000369209 5722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 196 ms