Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms