Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms