Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIM1P81133 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIM1P81133 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIM1P81133 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIM1P81133 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIM1P81133 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIM1P81133 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIM1P81133 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIM1P81133 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIM1P81133 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIM1P81133 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SIM1P81133 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIM1P81133 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIM1P81133 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SIM1P81133 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIM1P81133 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SIM1P81133 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SIM1P81133 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIM1P81133 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIM1P81133 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIM1P81133 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIM1P81133 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIM1P81133 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SIM1P81133 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIM1P81133 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIM1P81133 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIM1P81133 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIM1P81133 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SIM1P81133 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIM1P81133 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIM1P81133 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIM1P81133 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIM1P81133 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIM1P81133 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIM1P81133 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIM1P81133 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIM1P81133 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIM1P81133 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIM1P81133 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIM1P81133 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIM1P81133 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIM1P81133 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIM1P81133 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIM1P81133 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIM1P81133 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIM1P81133 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIM1P81133 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIM1P81133 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIM1P81133 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIM1P81133 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIM1P81133 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIM1P81133 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIM1P81133 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIM1P81133 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIM1P81133 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIM1P81133 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIM1P81133 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIM1P81133 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SIM1P81133 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIM1P81133 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIM1P81133 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIM1P81133 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIM1P81133 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIM1P81133 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SIM1P81133 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIM1P81133 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIM1P81133 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SIM1P81133 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIM1P81133 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIM1P81133 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIM1P81133 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIM1P81133 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIM1P81133 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIM1P81133 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIM1P81133 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIM1P81133 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIM1P81133 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIM1P81133 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIM1P81133 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIM1P81133 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIM1P81133 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIM1P81133 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIM1P81133 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIM1P81133 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIM1P81133 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIM1P81133 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIM1P81133 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIM1P81133 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIM1P81133 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIM1P81133 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIM1P81133 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIM1P81133 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIM1P81133 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIM1P81133 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIM1P81133 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIM1P81133 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIM1P81133 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIM1P81133 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIM1P81133 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIM1P81133 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms