Protein–RNA interactions for Protein: P48960

CD97, CD97 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD97P48960 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD97P48960 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD97P48960 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD97P48960 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD97P48960 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD97P48960 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD97P48960 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD97P48960 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD97P48960 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD97P48960 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD97P48960 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD97P48960 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD97P48960 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD97P48960 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD97P48960 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD97P48960 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD97P48960 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD97P48960 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD97P48960 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD97P48960 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD97P48960 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD97P48960 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD97P48960 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD97P48960 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD97P48960 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD97P48960 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD97P48960 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD97P48960 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD97P48960 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD97P48960 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD97P48960 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD97P48960 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD97P48960 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD97P48960 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD97P48960 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD97P48960 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD97P48960 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD97P48960 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD97P48960 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD97P48960 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD97P48960 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD97P48960 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD97P48960 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD97P48960 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD97P48960 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD97P48960 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD97P48960 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD97P48960 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD97P48960 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD97P48960 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD97P48960 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD97P48960 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD97P48960 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD97P48960 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD97P48960 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD97P48960 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD97P48960 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD97P48960 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD97P48960 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD97P48960 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD97P48960 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD97P48960 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD97P48960 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD97P48960 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD97P48960 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD97P48960 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD97P48960 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD97P48960 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD97P48960 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD97P48960 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD97P48960 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD97P48960 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD97P48960 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD97P48960 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD97P48960 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD97P48960 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD97P48960 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD97P48960 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD97P48960 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD97P48960 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD97P48960 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD97P48960 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD97P48960 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD97P48960 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD97P48960 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD97P48960 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD97P48960 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD97P48960 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD97P48960 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD97P48960 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD97P48960 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD97P48960 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD97P48960 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD97P48960 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD97P48960 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD97P48960 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD97P48960 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD97P48960 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD97P48960 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD97P48960 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms