Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TSFMP43897 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TSFMP43897 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TSFMP43897 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TSFMP43897 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TSFMP43897 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TSFMP43897 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TSFMP43897 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TSFMP43897 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSFMP43897 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TSFMP43897 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSFMP43897 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TSFMP43897 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TSFMP43897 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TSFMP43897 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSFMP43897 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSFMP43897 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TSFMP43897 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSFMP43897 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TSFMP43897 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TSFMP43897 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TSFMP43897 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TSFMP43897 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TSFMP43897 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TSFMP43897 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TSFMP43897 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSFMP43897 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSFMP43897 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSFMP43897 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TSFMP43897 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TSFMP43897 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TSFMP43897 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TSFMP43897 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSFMP43897 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSFMP43897 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSFMP43897 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TSFMP43897 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TSFMP43897 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSFMP43897 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TSFMP43897 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSFMP43897 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TSFMP43897 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TSFMP43897 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TSFMP43897 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSFMP43897 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSFMP43897 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSFMP43897 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TSFMP43897 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TSFMP43897 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSFMP43897 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSFMP43897 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TSFMP43897 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TSFMP43897 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSFMP43897 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSFMP43897 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TSFMP43897 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TSFMP43897 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TSFMP43897 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TSFMP43897 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSFMP43897 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TSFMP43897 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSFMP43897 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TSFMP43897 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TSFMP43897 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TSFMP43897 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TSFMP43897 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TSFMP43897 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSFMP43897 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSFMP43897 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TSFMP43897 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TSFMP43897 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TSFMP43897 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TSFMP43897 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TSFMP43897 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TSFMP43897 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TSFMP43897 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSFMP43897 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSFMP43897 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TSFMP43897 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TSFMP43897 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSFMP43897 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TSFMP43897 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TSFMP43897 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TSFMP43897 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSFMP43897 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSFMP43897 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSFMP43897 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TSFMP43897 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSFMP43897 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TSFMP43897 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSFMP43897 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSFMP43897 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TSFMP43897 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSFMP43897 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TSFMP43897 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSFMP43897 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TSFMP43897 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSFMP43897 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TSFMP43897 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TSFMP43897 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.7 ms