Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TO15178 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TO15178 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TO15178 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TO15178 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TO15178 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TO15178 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TO15178 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TO15178 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TO15178 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TO15178 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TO15178 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TO15178 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TO15178 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TO15178 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TO15178 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TO15178 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TO15178 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TO15178 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TO15178 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TO15178 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TO15178 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TO15178 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TO15178 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TO15178 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TO15178 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TO15178 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TO15178 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TO15178 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TO15178 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TO15178 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TO15178 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TO15178 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TO15178 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TO15178 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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