Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M5

KLHL20, Kelch-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL20Q9Y2M5 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL20Q9Y2M5 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms