Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms