Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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