Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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TRAF1Q13077 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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TRAF1Q13077 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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TRAF1Q13077 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
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TRAF1Q13077 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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