Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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HOXB9P17482 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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HOXB9P17482 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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HOXB9P17482 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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HOXB9P17482 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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HOXB9P17482 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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HOXB9P17482 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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HOXB9P17482 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HOXB9P17482 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HOXB9P17482 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HOXB9P17482 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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