Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGTAO43765 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGTAO43765 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGTAO43765 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGTAO43765 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGTAO43765 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGTAO43765 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGTAO43765 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SGTAO43765 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGTAO43765 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGTAO43765 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGTAO43765 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGTAO43765 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGTAO43765 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGTAO43765 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGTAO43765 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGTAO43765 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGTAO43765 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGTAO43765 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGTAO43765 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGTAO43765 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGTAO43765 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGTAO43765 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGTAO43765 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGTAO43765 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGTAO43765 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGTAO43765 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGTAO43765 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGTAO43765 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGTAO43765 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGTAO43765 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SGTAO43765 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGTAO43765 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGTAO43765 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGTAO43765 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGTAO43765 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGTAO43765 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGTAO43765 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGTAO43765 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGTAO43765 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGTAO43765 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms