Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms