Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC7

GALP, Galanin-like peptide, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALPQ9UBC7 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GALPQ9UBC7 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms