Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DDIT4Q9NX09 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDIT4Q9NX09 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms