Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms