Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms