Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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