Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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