Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX4Q12846 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX4Q12846 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX4Q12846 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX4Q12846 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
STX4Q12846 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
STX4Q12846 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
STX4Q12846 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
STX4Q12846 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
STX4Q12846 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
STX4Q12846 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
STX4Q12846 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
STX4Q12846 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
STX4Q12846 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
STX4Q12846 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
STX4Q12846 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
STX4Q12846 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
STX4Q12846 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
STX4Q12846 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
STX4Q12846 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
STX4Q12846 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
STX4Q12846 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
STX4Q12846 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
STX4Q12846 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
STX4Q12846 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
STX4Q12846 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
STX4Q12846 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
STX4Q12846 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
STX4Q12846 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
STX4Q12846 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
STX4Q12846 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
STX4Q12846 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
STX4Q12846 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
STX4Q12846 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
STX4Q12846 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
STX4Q12846 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
STX4Q12846 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
STX4Q12846 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
STX4Q12846 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
STX4Q12846 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
STX4Q12846 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
STX4Q12846 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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