Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms