Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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