Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms