Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNMO15061 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNMO15061 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNMO15061 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNMO15061 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNMO15061 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNMO15061 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNMO15061 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNMO15061 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNMO15061 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNMO15061 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNMO15061 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNMO15061 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNMO15061 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNMO15061 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNMO15061 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNMO15061 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNMO15061 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNMO15061 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNMO15061 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNMO15061 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNMO15061 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNMO15061 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNMO15061 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNMO15061 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNMO15061 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNMO15061 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNMO15061 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNMO15061 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNMO15061 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNMO15061 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNMO15061 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNMO15061 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNMO15061 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNMO15061 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNMO15061 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNMO15061 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNMO15061 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNMO15061 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNMO15061 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNMO15061 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNMO15061 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNMO15061 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNMO15061 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNMO15061 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNMO15061 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNMO15061 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNMO15061 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNMO15061 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNMO15061 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNMO15061 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNMO15061 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNMO15061 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNMO15061 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNMO15061 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNMO15061 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNMO15061 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNMO15061 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNMO15061 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNMO15061 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNMO15061 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNMO15061 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNMO15061 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNMO15061 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNMO15061 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNMO15061 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNMO15061 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNMO15061 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNMO15061 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNMO15061 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNMO15061 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNMO15061 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNMO15061 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNMO15061 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNMO15061 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNMO15061 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNMO15061 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNMO15061 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNMO15061 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNMO15061 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNMO15061 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNMO15061 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNMO15061 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNMO15061 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNMO15061 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNMO15061 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNMO15061 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNMO15061 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNMO15061 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNMO15061 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNMO15061 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNMO15061 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNMO15061 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNMO15061 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNMO15061 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNMO15061 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SYNMO15061 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SYNMO15061 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SYNMO15061 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SYNMO15061 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms