Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms