Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms